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请问go、kegg、panther、reactome和biocyc这几个数据库有什么差别？ 医学生做基因分析的时候要用到GO、KEGG、REACTOME、PANTHER和BioCyc等数据库进行分析，这些数据库都是做基因注释的，有关联，但也有…
Feb 18, 2022 · 【鼠小弟】Reactome注释 - 知乎 ... Reactome注释
例如，KEGG（京都基因和基因组百科全书）涵盖了大量物种的代谢途径和信号通路。而Reactome则专注于人类生物学途径。根据研究的需求，你可能需要选择一个更专门或更全面的数据库。 2.数据更新和维护：确保所选数据库定期更新并得到良好维护。过时或未维护 ...
Apr 25, 2023 · 13. reactome & kegg富集分析. 发布于 2023-04-25 08:45 ・IP 属地北京 · 473 次播放. 知乎，中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台，于 2011 年 1 月正式上线，以「让人们更好的分享知识、经验和见解，找到自己的解答」为品牌使命。. 知乎凭借认真 ...
网站展示出来的是top10的reactome pathway富集结果。但这里只是告诉我们差异基因（或自己上传的基因）主要参与调控哪些功能通路。真正精彩的内容在下载文件里，如下所示。
Pathway注释由生物学专家与Reactome编辑人员合作编写，并交叉引用许多生物信息学数据库。 这些包括NCBI Gene数据库，Ensembl和 UniProt数据库，UCSC基因组浏览器，KEGG 化合物和ChEBI小分子数据库，PubMed和 Gene Ontology。
总体来说，DNA甲基化一般遵循 三个步骤 进行数据挖掘。. 首先， 进行整体全基因组甲基化变化的分析，包括平均甲基化水平变化、甲基化水平分布变化、降维分析、聚类分析、相关性分析等。. 其次， 进行甲基化差异水平分析，筛选具体差异基因，包括DMC/DMR/DMG ...
Apr 16, 2023 · 途径分析（Pathway analysis）: 研究你感兴趣的基因所涉及的生物途径。 途径数据库如KEGG ( KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes )和Reactome ( Home - Reactome Pathway Database )提供了各种途径中分子相互作用和反应的详细信息，可以帮助您识别潜在的中间因素。
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基本原理：使用预定义的基因集（通常来自功能注释或先前实验的结果），将基因按照在两类样本中的差异表达程度排序，然后检验预先设定的基因集合是否在这个排序表的顶端或者底端富集。. 基因集富集分析使用了全部而不是单个、部分基因的表达变化 ...
