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一个生信小白在知乎上提问了如何在phytozome中找到的植物基因在NCBI上搜不到的问题,得到了两个回答。回答者分别介绍了不同数据库的更新频率、数据来源、注释差异和搜索策略,以及如何通过序列搜索、查看文献和联系数据库管理员的方法。
知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容,聚集了中文互联网科技、商业、影视、时尚、文化等领域最具创造力的人群,已成为综合性、全品类、在诸多领域 ...
Oct 20, 2019 · 本网页收集了多位用户对于如何在油菜中搜索拟南芥同源基因的回答,包括使用不同的数据库和工具,如phylogenes, NCBI BLAST, phytozome, PlantTFDB, BRAD, genoscope, Ensembl Plants等,以及注意拷贝数和功能蛋白的问题。回答中还提供了一些相关的参考资料和链接。
有没有哪位大佬知道phytozome网址怎么用呢? 生物学使用phytozome网址用来查询植物基因组和蛋白信息,但是我不会操作。 显示全部
Phytozome中基因水平表达量的图怎么看呀? 比如下面这个图显示的根部Root.ammonia, Root.nitrate等根部的显示,翻译出来是根氨,根硝酸盐,是在根部施加液氨、尿素得到的表达结…
Jan 14, 2021 · 知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容,聚集了中文互联网科技、商业、影视、时尚、文化等领域最具创造力的人群,已成为综合性、全品类、在诸多领域 ...
一个关于生物信息学和R语言的问题,询问如何将phytozome13下载的注释文件中的phytozomeID转换成ensemble或entrize ID,以便进行GO富集分析。两个回答提供了不同的方法和建议,包括使用官方对应映射关系或者自己编写方法。
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一个用户询问了如何在phytozome 13网站上使用基因关键词搜索,得到了两个回答。一个回答建议换浏览器,另一个回答表示遇到了同样的问题。
Jul 15, 2020 · 方法一:不同物种基因组上传的位置是不相同的,具体上传地点可以搜索到基因组发表的论文,方法部分或文末一般都会有能下载到对应文件的地址。方法二:在常用的数据库直接搜索也是常用的方法,例如NCBI,phytozome等。